多位点序列分析(MLST)_细菌分型的意义

多位点序列分析(MLST)_细菌分型的意义摘要:多位点序列分型(MLST)是一种基于核酸序列测定的细菌分型方法,通过PCR扩增多个管家基因内部片段,测定其序列,分析菌株的变异,从而进行分型

多位点序列分析(MLST)_细菌分型的意义

摘 要:

多位点序列分型(MLST)是一种基于核酸序列测定的细菌分型方法,通过PCR扩增多个管家基因内部片段,测定其序列,分析菌株的变异,从而进行分型。MLST被广泛应用于病原菌、环境菌和真核生物中。与传统分子生物学分型方法相比,MLST操作简单,具有更高的分辨力,能将同种细菌分为更多的亚型,并确定不同ST型之间的系统发育关系以及与疾病的联系。

多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)是一种基于核酸序列测定的细菌分型方法,通过PCR扩增多个管家基因内部片段,测定其序列,分析菌株的变异,从而进行分型。MLST是由多位点酶电泳(MLEE)衍生出来的一种分型方法,由Maiden等研究设计,于1998年首先应用于自然变异是的脑膜炎奈色球菌(Neisseria meningitides),后来被广泛应用于其它病原菌、环境菌和真核生物中。

与传统分子生物学分型方法相比,MLST具有更高的分辨力,能将同种细菌分为更多的亚型,并确定不同ST型之间的系统发育关系以及与疾病的联系。MLST操作简单,结果能快速得到并且便于不同实验室的比较,已经用于多种细菌的流行病学监测和进化研究。随着测序速度的加快和成本的降低,以及分析软件的发展,MLST逐渐成为细菌的常规分型方法。MLST越来越多的被作为能进行国际间菌株比较的常用工具,建立一种更为准确的分型系统方法。MLST目前已经成为了细菌分子流行病学研究的一种重要方法,可通过数据库与其它国家和地区的研究结果进行比对,从而更加全面的认识本地区细菌流行的特征。

多位点序列分型的原理:MLST方法一般测定6~10个管家基因内部400~600bp的核苷酸序列,每个位点的序列根据

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