Moudle(module-environment)是一个专门管理环境变量的工具。
在Linux中管理环境变量的方式一般都是通过写入profile或bashrc文件。当同一款运行库、软件存在多个版本,配置这些环境变量非常繁琐,而Moudle工具则先将不同软件的环境的配置文件写好,然后在使用的时候通过module来进行环境的导入以及删除。
1、安装Module
# yum install -y environment-modules
加载Module环境变量
# source /etc/profile.d/modules.sh
2、module file常用的语法
set version # 设置版本 set prefix # 设置安装目录 prereq # 设置依赖模块 prepend-path # 添加路径,类似于export PATH=xxx:$PATH setenv # 设置环境变量 append-path # 类似export PATH=$PATH:xxx
3、常用命令
# module avail # 显示可以使用的软件环境 # module load/add # 加载相应的软件环境 # module unload/rm # 卸载相应的软件环境 # module purge # 卸载所有软件环境 # module list # 列出所有软件环境 # module switch mod1 mod2 # 卸载mod1并导入mod2 # module show # 显示模块的配置文件
4、编写两个MPI Module文件
安装两个MPI软件
# yum install -y openmpi3 mpich-3.2
MPICH Module文件
# cat /etc/modulefiles/mpi/mpich-3.2 conflict mpi prepend-path PATH /usr/lib64/mpich-3.2/bin prepend-path LD_LIBRARY_PATH /usr/lib64/mpich-3.2/lib prepend-path PYTHONPATH /usr/lib64/python2.7/site-packages/mpich-3.2 prepend-path MANPATH /usr/share/man/mpich-3.2 prepend-path PKG_CONFIG_PATH /usr/lib64/mpich-3.2/lib/pkgconfig setenv MPI_BIN /usr/lib64/mpich-3.2/bin setenv MPI_SYSCONFIG /etc/mpich-3.2-x86_64 setenv MPI_FORTRAN_MOD_DIR /usr/lib64/gfortran/modules/mpich-3.2-x86_64 setenv MPI_INCLUDE /usr/include/mpich-3.2-x86_64 setenv MPI_LIB /usr/lib64/mpich-3.2/lib setenv MPI_MAN /usr/share/man/mpich-3.2 setenv MPI_PYTHON_SITEARCH /usr/lib64/python2.7/site-packages/mpich-3.2 setenv MPI_COMPILER mpich-3.2-x86_64 setenv MPI_SUFFIX _mpich-3.2 setenv MPI_HOME /usr/lib64/mpich-3.2
OpenMPI Module文件
# cat /etc/modulefiles/mpi/openmpi-3.1.3 conflict mpi prepend-path PATH /usr/lib64/openmpi3/bin prepend-path LD_LIBRARY_PATH /usr/lib64/openmpi3/lib prepend-path PKG_CONFIG_PATH /usr/lib64/openmpi3/lib/pkgconfig prepend-path PYTHONPATH /usr/lib64/python2.7/site-packages/openmpi3 prepend-path MANPATH /usr/share/man/openmpi3-x86_64 setenv MPI_BIN /usr/lib64/openmpi3/bin setenv MPI_SYSCONFIG /etc/openmpi3-x86_64 setenv MPI_FORTRAN_MOD_DIR /usr/lib64/gfortran/modules/openmpi3 setenv MPI_INCLUDE /usr/include/openmpi3-x86_64 setenv MPI_LIB /usr/lib64/openmpi3/lib setenv MPI_MAN /usr/share/man/openmpi3-x86_64 setenv MPI_PYTHON_SITEARCH /usr/lib64/python2.7/site-packages/openmpi3 setenv MPI_PYTHON2_SITEARCH /usr/lib64/python2.7/site-packages/openmpi3 setenv MPI_COMPILER openmpi3-x86_64 setenv MPI_SUFFIX _openmpi3 setenv MPI_HOME /usr/lib64/openmpi3
5、测试
加载MPICH
# module avail # module load mpi/mpich-3.2 # which mpirun
显示如下/usr/lib64/mpich-3.2/bin/mpirun
加载OpenMPI
# module switch mpi/mpich-3.2 mpi/openmpi-3.1.3 # which mpirun
显示如下 /usr/lib64/openmpi3/bin/mpirun
显示如下
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