探索消费级基因检测–祖源

探索消费级基因检测–祖源祖源是消费级基因检测比较感兴趣的问题 今天我也来学习一下那如何做一个简陋的祖源分析

祖源是消费级基因检测比较感兴趣的问题,今天我也来学习一下那如何做一个简陋的祖源分析。使用的是SPA(Spatial Ancestry analysis)这个软件,在google中搜索基因型填充无意中搜到了这个软件,由几个作者写成,第一作者还是华人,有点骄傲,可惜没有针对中国人或者东亚人的模型,只有世界和欧洲人的模型,瞬间又觉得有点失落,好在许多中国公司在积累了几万以上的数据后也开始进行中国人自己的模型构建,而且做得还不错。
先把软件官网放在这,http://genetics.cs.ucla.edu/spa
下面来根据官网步骤来操作一下:

1. 自己的数据结果,aff的芯片

./spa --mfile 23andMe.txt --model-input world.model --location-output world.loc ./spa --mfile 23andMe.txt --model-input europe.model --location-output europe.loc ./spa --mfile 23andMe.txt --model-input world.model --location-output world.loc -n 2 ./spa --mfile 23andMe.txt --model-input europe.model --location-output europe.loc -n 2 

 

2.中国人23andme的结果

3.欧洲人的结果

今天的文章 探索消费级基因检测–祖源分享到此就结束了,感谢您的阅读。
编程小号
上一篇 2025-01-05 14:33
下一篇 2025-01-05 14:30

相关推荐

版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 举报,一经查实,本站将立刻删除。
如需转载请保留出处:https://bianchenghao.cn/bian-cheng-ji-chu/102446.html