ped文件怎么打开（ped格式的文件怎么打开）生物学习路的开始阶段 需要了解记录基因的相关文件 文件不了解 基因分析完全做不了 开始学习基因文件 基因文件形式主要分类两大类 ped map bed bim fam 第一组 nbsp nbsp nbsp nbsp 在第一组文件中 做基因分析主要用 ped 文件即可 其中包含了每个个体 个体亲本 表现型 基因型在内的所有信息
生物学习路的开始阶段，需要了解记录基因的相关文件，文件不了解，基因分析完全做不了，开始学习基因文件。
基因文件形式主要分类两大类：
- ped + map
- bed + bim + fam
第一组：
在第一组文件中，做基因分析主要用ped文件即可，其中包含了每个个体、个体亲本、表现型、基因型在内的所有信息，map包含了ped中基因型的所有位置信息，该组数据方便人的阅读，但是在机器分析中运算速度低，不便于计算机使用。
ped（pedigree）文件
| FID | IID | PID | MID | Sex | P | rs1 | rs2 | rs3 |
| 1 | 1 | 0 | 0 | 2 | 1 | CT | AG | AA |
| 2 | 2 | 0 | 0 | 1 | 0 | CC | AA | AC |
| Family ID | Individual ID | Paternal ID | Maternal ID | Sex | Phenotype | Genotypes | ... | ... |
| 家族ID | 个人ID | 父亲ID | 母亲ID | 性别 | 表型 | 基因型 | | |
map文件
| chr | snp identifier | morgans | bp units |
| 染色体 | snp标识 | 基因距离 | 碱基距离 |
| 1 | rs1 | 0 | 1000 |
| 1 | rs3 | 0 | 1001 |
第二组：
该组文件主要是用于数据处理，bed文件是最大的文件，包含了最全的信息，计算机处理该文件速度较快，常用该组数据对基因数据进行分析。
bed文件：二进制文件，打开看不懂。
bim文件：
| chr | snp identifier | 摩尔距离 | 物理距离 | 次要等位基因 | 主要等位基因 |
| 1 | rs1 | 0 | 1000 | 0 | c |
| 2 | rs3 | 0 | 1001 | G | A |
fam（family）文件：包括了家庭信息文件
| FID | IID | PID | MID | Sex | P |
| 家族ID | 个人ID | 父亲ID | 母亲ID | 性别 | 表型 |
| 1 | 10000 | 0 | 0 | 1 | 1 |
| 1 | 10001 | 0 | 0 | 1 | 2 |
文件转换：
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