谱聚类算法原理与实现_geoda聚类分析

谱聚类算法原理与实现_geoda聚类分析谱聚类是从图论中演化出来的算法,它将聚类问题转换成一个无向加权图的多路划分问题。主要思想是把所有数据点看做是一个无向加权图 G = ( V,E ) 的顶点 V ,E 表示两点间的权重,数据点之间的相似度越高权重值越大。然后根据划分准则对所有数据点组成的图进行切图,使切图后不同的子图间的边权重和尽可能

  谱聚类是从图论中演化出来的算法,它将聚类问题转换成一个无向加权图的多路划分问题。主要思想是把所有数据点看做是一个无向加权图 G = ( V,E ) 的顶点 V ,E 表示两点间的权重,数据点之间的相似度越高权重值越大。然后根据划分准则对所有数据点组成的图进行切图,使切图后不同的子图间的边权重和尽可能低,而子图内的边权重和尽可能高,从而实现聚类的效果。

谱聚类算法原理与实现_geoda聚类分析

  简单来说,谱聚类一般有两个步骤:1. 图表示,将数据表示为图的形式,最常见的就是拉普拉斯矩阵;2. 图划分,根据划分准则对图进行切割,形成聚类。

1 相似性度量

  相似性度量是用来衡量数据之间的相似程度。在谱聚类中,无向图的权重就是用数据间的相似性来表示的。相似性度量的方法种类很多,一般需要根据实际情况进行选用。常用的度量方法有欧式距离、高斯核函数、余弦相似度等。

  1)欧式距离

  欧式距离是一种最为常用的度量方法,其定义如下:

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  其中 xi 与 xj 表示一个 d 维的数据点向量。一般来说,数据点之间距离越*,相似度越高。在特征空间中,欧式距离具有转化和旋转的不变性,因此更倾向于构建球形的聚类簇。

  2)高斯核函数

  谱聚类中常使用高斯核函数来定义边的权重,其计算公式为:

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  其中 xi 与 xj 表示一个 d 维的数据点向量,σ 为函数的宽度参数。参数 σ 的值越大,数据点之间的相似性越高,需要根据实际情况调整。从式中可以看出,如果数据点之间的欧氏距离远高于参数 σ 的值,高斯核函数的值就会趋*于零,因此只有与 σ 值相当的数据点间的距离才会起作用。

  3)余弦相似度

  余弦相似度常使用在文本聚类中,其表示形式为:

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  在文本聚类中,传统的欧式距离往往不能很好地描述文本对象之间的相似性,此时就需要非距离测量的相似性度量。对于余弦相似度来说,越是相似的样本,在特征空间里越趋*于*行,其余弦值也越大。

2 相似矩阵、度矩阵、拉普拉斯矩阵

  给定包含了 n 个数据点的集合,可以构建一个无向加权图 G = ( V,E ) ,其中 V 表示数据集里所有的点 (v1, v2, … , vn) ,对于 V 中任意两个点 ,都可以有边连接。确定相似性度量方法后,就可以得到各个边的权重,定义权重 wij 为点 vi 和点 vj 之间的边权重,即可得到相似矩阵 W。由于该图是无向图,所以 wij =wji 且 wij ≥ 0。

  对于图中的任意一点 vi ,它的度 di 定义为与它相连的所有边的权重之和,即:

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  通过该定义,我们就可以得到一个 n × n 的度矩阵 D = diag( d1, d2, …, d)。通过相似矩阵 W 和度矩阵 D,就可以计算出拉普拉斯矩阵 L = D – W,它有一些很好的性质:

  1)由 W 和 D 都是对称矩阵,可以推出拉普拉斯矩阵是对称矩阵;

  2)由于拉普拉斯矩阵是对称矩阵,所以它的所有特征值都是实数;

  3)对于任意的向量 f ,可以推导出:

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  4)由性质3可知,拉普拉斯矩阵是半正定的,且对应的 n 个实数特征值都大于或等于零。

  这些性质会在之后的优化中用到。

3 图的划分准则

  谱聚类算法将聚类问题转化成图的划分问题,最优划分原则是切图后不同的子图间边权重和最小,而子图内的边权重和最大,要找到满足这个优化问题的解是一个NP-难的问题,因此需要使用维数归约的思想去*似地解决这个问题。聚类结果的好坏会直接受划分准则的影响,常见的划分准则有最小割集准则 (Minimum cut,Mcut)、比例割集准则 (Ratio cut,Rcut)、规范割集准则 (Normalized cut,Ncut) 等。

  要将无向图 G 划分成 k 个相互无连接的子图,每个子图点集合为 A1, A2, … , Ak ,它们满足 Ai ∩ Aj = Φ 且 A1∪A2∪…∪Ak = V。对于任意两个子图点的集合 A, B ∈ V,A ∩ B = Φ,定义 A 和 B 子图之间的权重为:

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  1)最小割集准则希望使子图之间的边权重之和最小,其代价函数为:

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  其中 ‾A为  Ai  的补集。通过最小化上述代价函数来实现图的分割,在一些图像分割上取得了不错的效果,但该准则很容易出现倾斜分割的现象,因此又提出了规范割集准则和比例割集准则来限制每个子图的规模。

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  2)比例割集准则不仅考虑最小化子图间的权重和,还考虑最大化每个子图中点的个数,其目标函数为:

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  其中 |Ai| 表示子集 A中点的个数。Rcut 避免了倾斜分割的问题,但运行效率不高。

  3)规范割集准则与比例割集准则相似,该准则考虑的是最大化每个子图中的权重和,目标函数为:

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  其中 vol( A) 表示子集 A中的权重和。

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4 Ncut 聚类

  在谱聚类中,最常用的相似性度量是高斯核函数,最常用的划分准则是 Ncut。下面主要介绍如何最小化 Ncut 目标函数得到聚类结果。引入一个指示矩阵 H ∈ Rn×k,其中包含 k 个 n 维指示向量 hj ∈ { h1, h2, … ,hk },定义 hij 为:

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  可以推导出:

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  其中 L 为拉普拉斯矩阵。优化目标为:

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  且 HTDH = I,D 为度矩阵。因此,优化目标为:

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  令 H = D-1/2F,则:HTLH = FTD-1/2LD-1/2F,HTDH = FTF = I,也就是说优化目标变成了:

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   D-1/2LD-1/2 相当于对拉普拉斯矩阵 L 进行标准化。可以观察到 tr( FTD-1/2LD-1/2F ) 中每一个优化子目标 fiTD-1/2LD-1/2fi ,其中 fi 是单位正交基,D-1/2LD-1/2 是对称矩阵,此时  fiTD-1/2LD-1/2fi 的最小值就是 D-1/2LD-1/2 的最小特征值,因此,只需要找到最小的前 k 个特征值以及其对应的特征向量,标准化后就可以得到最后的特征矩阵 F,从而*似地解决这个NP难的问题。由于在该过程中损失了少量信息,得到的矩阵 F 不能完全指示各样本归属,因此需要再使用一次 k-means 算法或其他离散化过程。

  下面总结 Ncut 聚类流程:

  输入:数据集 X = { x1, x2, … , xn },聚类个数 k

  输出:簇划分

  1. 根据数据集构造相似矩阵 W,度矩阵 D ;

  2. 计算拉普拉斯矩阵 L,并标准化 D-1/2LD-1/2 

  3. 计算 D-1/2LD-1/2 最小的 k 个特征值对应的特征向量 f ;

  4. 将各个特征向量 f 组成的矩阵按行标准化,组成特征矩阵 F ∈ Rn×k

  5. 将 F 中的每一行作为一个 k 维的数据点,使用 k-means 或其他离散化过程获取聚类指标。

  可以看出,PCA 优化过程与谱聚类非常相似,只不过谱聚类是找前 k 个最小的特征值对应的特征向量。

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