oligo
常用函数
1 darkColors
功能：提供颜色。
返回值：表示颜色的字符。
darkColors(n) seqColors(n) seqColors2(n) divColors(n) 注意：darkColors是基于RColorBrewer包设计的。
2 fitProbeLevelModel
功能：对FeatureSet拟合robust Probe Level linear Models。
返回值：oligoPLM对象。
fitProbeLevelModel(object, background=TRUE, normalize=TRUE, target="core", method="plm", verbose=TRUE, S4=TRUE, ...) | 参数 | 注释 |
|---|---|
| object | FeatureSet对象。 |
| target | 描述汇总目标。默认为”core”。可输入”probeset”,”core”(Gene/Exon),”full”(Exon),”extended”(Exon) |
| verbose | 显示进程。默认为TRUE。 |
注意：由于oligo包读取的文件对象与affy包读取的文件对象不同，因此无法使用affyPLM包中的fitPLM函数拟合探针水平模型。oligo包读取的
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glm函数包_OL指标公式源码分享到此就结束了，感谢您的阅读。
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