win 11安装条件_戴尔笔记本安装win11「建议收藏」

一，介绍

作为处理弥散脑成像数据的主流软件之一，FSL是很多脑科学研究者的必备工具。遗憾的是，该软件只能在Linux（或者类Unix）操作系统下运行。通常大家使用FSL的方式有两种：（1）在Windows PC上额外安装一个Linux系统，来使用FSL；（2）在Windows PC上安装一套虚拟机软件（如VirtualBox或者VMware）,在虚拟机中安装Linux系统来使用FSL。这两种方式各有缺点，第一种方式使得我们无法使用Windows系统的一些常用软件；第二种方式由于虚拟机使用的是虚拟硬件，使得FSL的运行效率大打折扣。

鉴于以上问题，本文介绍一种在Windows系统下使用FSL的方法，该方法既可以使得FSL充分发挥其运行效率，又可以让大家方便地使用Windows系统下的软件。

二，安装WSL2

可以介绍我们的大杀器了——WSL2！微软于前两年正式发布了其新一代Linux子系统应用WSL2，可以让用户以接近原生Linux的性能运行Linux图形应用程序。时至今日，WSL2已足够完善，堪任程序猿/媛们的生产力工具。很多程序猿/媛喜欢使用苹果Mac系统，就是因为Mac系统拥有类似Linux系统的强大命令行工具，又可以使用诸如Office、微信等日常应用。现在有了WSL2，使得Windows PC + WSL2也是一个不错的选择！

2.1 WSL2的安装流程

先介绍WSL2的安装流程。
打开Windows PowerShell，右键选择“以管理员身份运行”。

输入命令 wsl –install 安装WSL2。

安装成功后，系统可能会提示需要重启，重启电脑即可。重启后可以在Windows菜单中找到Ubuntu应用，该Ubuntu系统具有原生Ubuntu系统的所有功能，并且可以和Windows系统无缝集成。

打开Ubuntu应用，首次使用时会提示设置用户名和密码，大家按需设置即可。例如将用户名设置为weiwang，密码简单地设置为1。

之后便可以顺利地进入Linux子系统，可以看到，进入后默认在home目录：

至此，WSL2 Linux子系统安装完毕。

2.2 WSL2 Linux子系统在Windows中的位置

在安装FSL之前，我们先介绍一下安装好的Linux子系统如何和Windows共享文件。
打开Windows的文件管理器，在地址栏中键入 \wsl$ ，按回车键即可进入Linux子系统的文件夹。

双击即可进入Linux的文件系统，笔者在这里进入到了Linux的新建立的qwbrain用户的home目录。

在这里，我们可以像操作Windows的任何文件夹/文件一样，在Linux子系统目录里进行复制、粘贴等操作。将来要跑脑影像的数据，就可以放在这个目录里。

至此，Windows和WSL2 Linux子系统的文件共享，介绍完毕。

三，在WSL2下安装 FSL

3.1 官网下载FSL安装脚本

官网地址：https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/

搜索引擎中找到FSL官网，打开Download/Install界面，填写相关信息后，我选择了Ubuntu 20 版本，然后点击Register，即可进入安装脚本的下载页面。

点击 Download 超链接下载需要的脚本文件

下载好的安装脚本名称为fslinstaller.py，基于Python语言编写。

把这个安装脚本拷贝到Linux子系统的home目录中，直接在Windows系统文件管理器中复制粘贴即可 😃

3.2 安装FSL

下面可以准备在Linux子系统中运行安装脚本，安装FSL了。
首先更新一下Linux子系统。过程中如果提示输入用户名和密码，自行输入即可:
输入指令：

sudo apt update

3.2.1 安装python2

FSL的安装脚本是用Python2写的，新版本的Ubuntu （16以后）在默认情况下没有安装Python2。在终端输入 python2，若提示没有相应的命令，则需要先安装Python2，如下指令：

sudo apt install python2

报错1：
Ubuntu20.04 “sudo apt-get install python2“导致”E: Unable to locate package python2
Unable to locate package
解决方法：
Linux Ubuntu系统下python2的安装
背景：官方早年前已经宣布停止 Python 2 的更新和服务，所以对于ubuntu20版本之后的，都是自带安装了python3，但是我们在处理安装某些大型科学计算程序的时候，往往需要用到一些老版库和程序，此处以python2安装的FSL为例，关于安装python2的报错，我尝试了很多方法都不行：

sudo apt-get update
sudo apt-get upgrade
sudo apt-get install python2.7

结果：Unable to Locate package
与此同时尝试更换了各种各样不同的源（阿里源，清华源都还是一样的报错问题）
但是，往往我们忽略了官方停止更新服务的背景，所以关键问题还是出在源的选择和载入上，正确的解决办法如下：
启用 universe 源仓库：

sudo add-apt-repository universe

更新源，并安装：

sudo apt update 
sudo apt install python2

查看安装是否成功：

python2 --version

这时终端会返回py2的版本号，安装成功！

解决操作参考：
Unable to Locate package python2 | Linux Ubuntu系统下python2和cif2cell的安装
Windows11下安装FSL 最全图文教程 及 踩坑解决

Python2安装完毕后，就可以正式运行fslinstaller.py安装脚本了！

3.2.2 FSL安装

Python2安装成功后可开始用下载的**.py**文件安装FSL。
首先，使用sudo su 获得权限：在开始安装之前需要用sudo命令，给予管理权限。

sudo su
输入密码

然后找到并进入 把fslinstaller.py拷贝过来的地址，我的是在 /home/weiwang/文件夹下：

然后输入指令：执行安装

python2 fslinstaller.py

在安装的过程中，默认安装在 /usr/local 路径中，直接回车默认安装路径就好。

报错2：
ERROR occurred during installation!
This command returned an error: /opt/fsl/bin/mamba env update -n base -f /tmp/tmpvHdlnZ/fsl-6.0.7.2_linux-64.yml
Removing failed installation directory /opt/fsl
原因及解决：
查看log文件，发现是内存不够了。因为我的WSL2的ubuntu20.04安装在C盘。C盘当时大小只有10个G。然后我就把微信给暂时卸载了。C盘一下剩余20个G，然后再次运行。后期安装成功了再来看这个FSL的大小：约10个G

解决完报错2之后，再次运行python2 fslinstaller.py：又出现了报错3：

报错3：ERROR occurred during installation!
**[Errno socket error][Errno 11] Resource temporarity unavailable **

原因及解决：
connection time out. 网络问题。这步很容易挂掉，我安了五六次才成功。可以换一个网络环境，或者换个时间试一试。 建议多python2几次，然后就能下载了。

然后总算可以正常安装了。安装中： FSL的安装的时间是最长的，毕竟有那么大。

很多人在 FSL into usr/local/fsl 这一步骤非常的慢，我也是这样，在100%哪里停了很久。建议还是多等等吧，毕竟文件那么大。
下载的时候看个电影（狗头保命）

等待FSL自行安装即可，这一步耗时比较长，过程中需要保证网络通畅，网速慢可能会导致安装失败。有条件的可以考虑翻墙，可提高成功率。
安装完成后，并重新登入。

3.2.3 配置环境变量

安装完成之后，重新打开Ubuntu，使用指令检查环境：

echo $FSLDIR

如果没有东西显示则需要手动配置环境变量。

环境变量配置：环境变量就是为了无论当前目录是哪 都能直接调用这个软件的，所以要指明这个软件安装的位置
**1.命令行输入 **

sudo vim /etc/profile

目的是为了操作etc目录下的profile文件。

在最后面输入（fsl默认安装在/usr/local/fsl目录下）：
再普及一下linux下如何使用vim输入：
按下 ‘i’ 键输入，将下面两行复制过去。
然后 ‘Esc’键，然后 英文 ‘：’，然后输入 wq! ， 再 回车就可以保存修改。

export PATH=$PATH：/usr/local/fsl/bin
export FSLDIR=/usr/local/fsl

如果打开后是一个空文件有可能是命令（etc/profile）输错了：或者你cd 到etc的上一级目录上再输入指令：

2. 在命令行输入

sudo vim /etc/bash.bashrc

在最后面输入：

 FSLDIR=/usr/local/fsl
. ${FSLDIR}/etc/fslconf/fsl.sh
PATH=${FSLDIR}/bin:${PATH}
export FSLDIR PATH

如果打开后是一个空文件有可能是命令（etc/bash.bashrc）输错了

3. 重新激活环境变量配置
在命令行输入 ，记得到

source /etc/bash.bashrc
source /etc/profile

3.2.4 检查FSL安装情况

检验是否下载成功：
通过执行以下操作来测试环境和命令行工具是否设置正确：

• 启动一个新的终端会话
• 通过键入以下内容检查您的环境是否正确：

echo $FSLDIR

这应该显示您安装 FSL 的目录的名称。默认在：/usr/local/fsl

• 通过键入以下内容检查您的路径是否正确

flirt -version

应该显示：FLIRT version 6.0. 版本号可能不同

• 检查 miniconda 环境安装是否成功完成

which imcp

它应该显示如下一行：

/usr/local/fsl/bin/imcp

3.3 调用FSL

在完成FSL的安装和环境配置之后，我们打开Ubuntu输入指令 fsl
报错4:
application-specific initialization failed: no display name and no $DISPLAY environment variable
Error in startup script: no display name and no $DISPLAY environment variable

原因及解决：
我看帖子上说报错是正常的，因为fsl启动是一个图形界面，linux无法打开一个图形界面。
比如下面这两个帖子都是另外又安装的软件：
解决办法：
然后我安装了 xlaunch，设置了Display number选择0。
然后在WSL上输入指令：
export DISPLAY=localhost:0
然后再输入fsl，就可以在xlaunch上显示fsl了：

【FSL 安装教程】
Windows11下安装FSL 最全图文教程 及 踩坑解决
【安装fsl】
安装fsl_fsl安装_weixin_46194542的博客-CSDN博客

3.3.1 WSL安装桌面面并通过XLaunch访问

为什么需要桌面，有些时候，使用图形界面可以方便我们的开发（比如使用cmake-gui），所以为WSL安装图形界面是有实际价值的，并且可以通过XLaunch远程连接桌面。
1，安装Xlaunch，直接默认安装就行了。
https://sourceforge.net/projects/vcxsrv/
2,WSL安装必要软件

//先更新apt-get
sudo apt-get update && sudo apt-get upgrade -y

//安装XFCE桌面环境
sudo apt-get install xfce4 -y

//将必要软件安装到XFCE桌面
sudo apt-get install xfce4-goodies -y

3，配置Xlaunch,
打开X-Launch软件，选择One large window, Display number选择0

然后就是疯狂的下一步，直到出现黑色窗口。
然后可以保存 config设置。

4,为WSL添加环境变量

//这个0和Display number选择0 是对应的
export DISPLAY=localhost:0

//要更新下环境变量才能立即生效
source /etc/profile

//打开xfce4,以后每次使用时需要输入此命令
startxfce4

参考：
【WSL安装桌面面并通过XLaunch访问】
Windows11下安装FSL 最全图文教程 及 踩坑解决

四，FSL颅骨剥离测试使用

下面，我们来测试一下Linux子系统中FSL的运行状况吧。
在Linux子系统的home目录中新建一个test文件夹，开放其所有权限，并拷贝一份测试数据进去。

给文件夹开权限：

打开FSL工具：脑提取工具

点击后进入如下界面，选择input image文件，output image会自动添加_brain后缀。
然后点击 go运行提取。

使用itk-snap查看效果：
原始图像：

颅骨剥离后：

参考连接：
重点参考：
【MRI数据预处理–使用FSL-BET轻松去头骨，提取脑组织】
Windows11下安装FSL 最全图文教程 及 踩坑解决

【打造脑影像工作站】Windows安装FSL图文教程
https://zhuanlan.zhihu.com/p/618637035

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